WARファイルはWebアプリケーションに必要なHTML、JSP、classなどのファイルを一まとまりにまとめたもので、主にWebアプリをアプリケーションサーバに配置する際に使用します。WARファイルをアプリケーションサーバの所定の位置に配置することで（Tomcatの場合は、$CATALINA_HOME\webapps）、WARファイルが自動展開され、Webアプリを実行可能な状態にすることができます。
http://www.javaroad.jp/opensource/js_eclipse6.htm
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